Zajęcia 1.
- Dane w formacie FASTA
Bacillus anthracis,
Escherichia coli,
Drosophila melanogaster - Pozycje genów w Drosophila
geny.csv - Przykładowy skrypt dla pakietu seqinr
pakietSEQINR.R - Przykładowa macierz
PWM - Odpowiedzi i przykładowe skrypty do zadania 1
odpowiedziSEQINR.r
Zajęcia 2
- Pytania, odpowiedzi i przykładowe skrypty do zadania 2, dotyczącego lokalizacji QTLi
odpowiedzi2QTL.r - Plik z danymi do zadania, zapisany w postaci Rdata (do wczytania funkcją load())
Drosophila.zip - Artykuł na którym bazuje drugie zadanie
pdf
Zajęcia 3
- Prezentacja Bioinfo3.pdf
- Zbior danych amino aminkw.zip
- Zbior danych spellman spellman.zip
- Artykul opisujacy zbior danych o ekspresji http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9843569
- Zadania zadaniaBioinfo3.r
- Przyklad przykladBioInfo3.r.txt
Zajęcia 4
- Ciekawy artykuł pca
- Cwiczenia z klasyfikacji danych o bialaczce cwiczenia4RBioinfo.r